海南大学食品科学与工程学院源自于1958年华南热带作物学院热带作物产品加工专业。2007年，由华南热带农业大学理工学院食品科学与工程系和原海南大学海洋学院食品科学与工程系合并组建而成，是我国第二批经国务院批准具有硕士学位授予权的单位。先后获批“农产品加工及贮藏工程（1983）”、“食品科学”硕士点（2006）和“食品科与工程”一级学科硕士点（2011）和一级学科博士点（2018）。其中“农产品加工及贮藏工程”是农业部（1993）和海南省（2005）重点学科。现有食品科学与工程一级学科博士点（2018）、食品科学与工程一级硕士授权点（2011）以及食品工程（工程硕士）、食品加工与安全（农业硕士）两个专业硕士授权点。学院下设食品科学与工程、食品质量与安全两个系和1个实验中心； 其中“食品科学与工程”专业是国家级一流本科专业建设点（2019）和国家级特色专业（2007），并通过教育部工程教育专业认证。“食品质量与安全”专业是省级一流本科专业建设点（2020）和省级特色专业（2013）。全日制在校学生1103人，其中本科生784人，研究生，357人，其中博士生38人，硕士生319人。
本学院依托有食品科学与工程学科优势，结合海南省是我国唯一热带岛屿省份和最大海洋省、热带农产品和海洋生物资源丰富等地理和资源禀赋，构建了以热带农产品加工与安全及海洋资源高值化利用为特色的专业相对完善的人才培养体系，逐步形成了鲜明“热带、海洋、产学研”特色，为国家和热区培养了数以千计本、硕、博多层次复合应用型热带农产品加工技术人才，已成为重要科研人才培养基地，为海南热带农产加工与安全及其相关产业形成与发展做出卓越贡献。
经过近年来的建设，学院基本形成一支年龄、职称、学历和学缘结构合理，老中青相结合，多学科交叉融合的可持续发展的学术梯队。现有专任教师56人。其中博士学位教师52人，占总人数的92.86%；具有正高职称教师17人，占总人数的30.36%；具有副高职称教师27人，占总人数的48.21%；1人入选海南省杰出人才，6人入选海南省领军人才，22人入选海南省拔尖人才，1人入选海南省南海名家，3人入选海南省南海名家青年项目，8人入选海南省“515人才工程”。55人获得海南省其他类（E类）高层次以上人才称号。
2015年以来，本学院共承担各级各类项目230项，项目总经费5222.26万元。发表论文616篇，其中SCI论文249篇。出版教材和专著25部，获国家授权专利20多项，获海南省科技进步奖6项。拥有南海海洋资源利用国家重点实验室（2016）、热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地（2009）、热带多糖资源利用教育部工程研究中心（2019）、农业部农产品质量安全风险评估实验室（海口）（2011）和国家对虾加工技术研发分中心（海口）（2010）、国家罗非鱼加工技术研发分中心（海口）（2010）、海南省食品科学研究所（2006）、海南省食品营养与功能食品重点实验室（2019）、海南省南海水产资源高效利用工程研究中心（2019）、国家市场监管重点实验室（热带果蔬质量与安全）（2021）和3个海南院士团队创新中心（2019，2021）等多个省部级科研平台。专业实验室面积6300 m2，仪器设备总值8500多万元，拥有专业信息网络平台和较充足国内外图书资料。
与岛内外50余家食品工业企业建立生产实习基地和产学研合作关系。同时，广泛开展国际交流与合作，先后与美国、日本、澳大利亚、加拿大、泰国、马来西亚、柬埔寨等国及台湾、香港地区有关高等院校和科研院所建立了校际联系。逐渐形成了鲜明“热带、海洋、产学研”特色，为海南自由贸易区（港）建设乃至全国热带农产品加工产业的发展做出了应有的贡献。
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